科室运用中医、中西医结合方法诊断和治疗泌尿系统、男性生殖系统疾病，突出中医特色，采用辨病与辨证相结合;手术治疗与非手术治疗相结合;传统手术与泌尿外科微创手术相结合;预防与治疗相结合方法;在泌尿系结石、前列腺疾病、泌尿生殖系感染、泌尿生殖系肿瘤、不孕不育、性功能障碍等疾病的综合治疗上积累了丰富的经验，取得了良好的临床疗效。科室设有“云南省中医医院泌尿系结石病中心”、“生殖医学中心”。科室拥有进口丹麦尿动力学检测仪;德国Wolf尿道膀胱腔镜、输尿管镜、肾镜;英国Gyrus低温等离子电切镜;钬激光手术系统;日本Olympus腹腔镜手术系统;并建有完整的生殖实验室，有精液分析仪、阴茎血流检测仪、前列腺综合治疗仪、勃起功能障碍治疗仪、男科诊疗工作站等先进诊疗设备。
在诊治疾病的同时，强调疾病的预防工作，积极宣传疾病的保健、生活起居的调养，每年冬季开设膏方门诊。